Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Phf11bB4XVQ1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Phf11bB4XVQ1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms