Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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