Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms