Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms