Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms