Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prr29B1ARI9 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prr29B1ARI9 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prr29B1ARI9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms