Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PtprsB0V2N1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms