Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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