Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3550W4VSN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3550W4VSN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms