Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vstm4T1NXB5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vstm4T1NXB5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms