Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms