Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn7Q9Z261 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn7Q9Z261 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn7Q9Z261 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms