Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17h6s53eQ9Z1R4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms