Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms