Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx39bQ9Z1N5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms