Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cog1Q9Z160 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms