Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cpne6Q9Z140 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms