Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp2Q9Z0Z3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms