Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PapolbQ9WVP6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PapolbQ9WVP6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms