Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArcQ9WV31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArcQ9WV31 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218 ms