Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus1Q9WU56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pus1Q9WU56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms