Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nrf1Q9WU00 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms