Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf2Q9WTU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf2Q9WTU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf2Q9WTU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms