Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma1Q9R1P4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms