Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trex2Q9R1A9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trex2Q9R1A9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms