Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b2Q9R0K7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atp2b2Q9R0K7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp2b2Q9R0K7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b2Q9R0K7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b2Q9R0K7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms