Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plod1Q9R0E2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plod1Q9R0E2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plod1Q9R0E2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.1 ms