Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AmfrQ9R049 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AmfrQ9R049 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms