Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn8Q9QZ49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn8Q9QZ49 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms