Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phtf1Q9QZ09 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phtf1Q9QZ09 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms