Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd1Q9QY80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd1Q9QY80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd1Q9QY80 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms