Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rad18Q9QXK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad18Q9QXK2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms