Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim44Q9QXA7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim44Q9QXA7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms