Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdcQ9QW08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdcQ9QW08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms