Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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Trpc4Q9QUQ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trpc4Q9QUQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Trpc4Q9QUQ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Trpc4Q9QUQ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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Trpc4Q9QUQ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Trpc4Q9QUQ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Trpc4Q9QUQ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Trpc4Q9QUQ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trpc4Q9QUQ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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