Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cdkl2Q9QUK0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl2Q9QUK0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms