Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms