Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a3Q9JKZ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc5a3Q9JKZ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms