Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot9Q9JKY0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms