Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Habp4Q9JKS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Habp4Q9JKS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Habp4Q9JKS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Habp4Q9JKS5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Habp4Q9JKS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Habp4Q9JKS5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Habp4Q9JKS5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms