Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb3Q9JKS4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms