Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms