Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp5Q9JKD3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp5Q9JKD3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms