Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ybx3Q9JKB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ybx3Q9JKB3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ybx3Q9JKB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms