Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RprmQ9JJ72 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RprmQ9JJ72 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms