Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LratQ9JI60 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LratQ9JI60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms