Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pus3Q9JI38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus3Q9JI38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus3Q9JI38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms