Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Brd4Q9ESU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Brd4Q9ESU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms