Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb6Q9DC29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb6Q9DC29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb6Q9DC29 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb6Q9DC29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb6Q9DC29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb6Q9DC29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms