Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riok3Q9DBU3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Riok3Q9DBU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Riok3Q9DBU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms